Esta lista presenta el orden cronológico en que se estrenaron las películas, especiales, ovas y magic files en relación a los capítulos. Es recomendable verlas en el orden que se muestra aquí para evitar posibles spoilers que aparezcan en estos.
En la lista se muestra siempre el episodio anterior a cada uno. Las películas se muestran de color rojo, los magic files con color verde, las ovas con color morado y los especiales con color celeste.
| Listado |
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| Episodio 54: El Caso de Asesinato en una Compañía de Videojuegos. |
| Película 1: La Bomba en el Rascacielo |
| Episodio 55: El Caso de Asesinato del Truco del Tren. |
| Episodio 96: ¡El Detective Acorralado! Dos Grandes Casos de Asesinato en Serie (Especial 2 horas) |
| Película 2: El Decimocuarto Objetivo |
| Episodio 97: El Caso de Asesinato del Vino de Despedida |
| Episodio 142: El Caso de la Sala Cerrada la Noche Antes de la Boda (2º Parte) |
| Película 3: El Mago del Fin del Siglo |
| Episodio 143: La Sospechosa Observación Astronómica |
| Episodio 186: El Famoso Detective Asesinado (2º Parte) |
| Película 4: El Asesino Dentro de la Mirada |
| Episodio 187: El Misterioso Tiro que Resuena en la Oscuridad |
| Episodio 219: Reunión de Grandes Detectives! Shinichi Kudo vs. Kaito Kid (Especial 2 horas) |
| OVA 1: Conan vs Kid vs Yaiba |
| Episodio 231: El Pasajero Misterioso (2º Parte) |
| Película 5: La Cuenta Regresiva al Cielo |
| Episodio 232: El Caso de la Caída Desde la Mansión |
| Episodio 263: El Doble Misterio de Osaka: El Espadachín de Naniwa y el Castillo de Taiko (Especial 2 horas) |
| OVA 2: 16 Sospechosos |
| Episodio 273: El Caso de la Desaparición de la Abuela de los Acertijos |
| Película 6: El Fantasma de Baker Street |
| Episodio 274: La Verdad de la Casa Embrujada (1º Parte) |
| Episodio 304: ¡Temblorosos Cuarteles Generales de la Policía! 12 Millones de Rehenes (Especial 2 horas.) |
| OVA 3: Conan, Heiji y el Niño Desaparecido |
| Episodio 315: El Aspecto del Lugar del Golpe |
| Película 7: La Encrucijada del Laberinto |
| Episodio 316: La Máscara Sucia de un Héroe (1º Parte) |
| Episodio 345: Frente a frente con la Organización de los Hombres de Negro, el Misterio Doble del Juego de Vida o Muerte en la Noche de Luna Llena (Especial 2 horas y media) |
| OVA 4: Conan, Kid, y el Crystal Mother |
| Episodio 356: El Milagroso Caminar por los Aires de Kaito Kid (Especial 1 hora) |
| Especial Promoción Película 8: Viaje en el Tiempo en el Cielo Plateado |
| Película 8: El Mago de las Alas Plateadas |
| Episodio 357: Un Amante es una Fantasía de Primavera |
| Episodio 384: El Objetivo es Kogoro Mouri |
| OVA 5: ¡El Objetivo es Kogoro Mouri! La Investigación Secreta de los Jóvenes Detectives |
| Episodio 393: Secuestro... Incidente Apropiado |
| Película 9: La Estrategia sobre el Horizonte |
| Episodio 394: Gran Aventura en la Extraña Mansión (Sello) |
| Episodio 425: ¡Impacto Negro! Cuando las Manos de la Organización te Alcanzan (Especial 2 horas y media) |
| OVA 6: ¡La Persecución del Diamante Desaparecido! Conan & Heiji vs Kid |
| Episodio 437: La Promesa de Shinichi y Aya Ueto de hace 4 años |
| Película 10: El Réquiem de los Detectives |
| Episodio 438: Búsqueda del Correo de los Pescadores |
| Episodio 460: La Gran Batalla de la Clase 1º B |
| OVA 7: Un Desafío Escrito de Agasa |
| Episodio 465: La Sombra de la Organización de los Hombres de Negro (Estrella Brillante de Perla) |
| OVA Especial: Historia de los Hombres de Negro |
| Episodio 470: Kaito Kid y los 4 Cuadros Famosos (2º Parte) |
| Película 11: El Jolly Roger Cerúleo |
| Magic File 1: Composición Episodios 132, 133, 134 & 196 |
| Episodio 471: Alquilar un Coche que no se Puede Controlar. |
| Episodio 490: ¡Heiji Hattori vs. Shinichi Kudo! La Batalla de la Gran Deducción (Especial 1 hora) |
| OVA 8: La Chica Detective de Preparatoria, los Casos de Sonoko Suzuki |
| Episodio 504: Choque Entre lo Rojo y lo Negro. Muerte en el Cumplimiento del Deber |
| Magic File 2: Shinichi Kudo: El Caso de la Misteriosa Pared y el Labrador Negro. |
| Película 12: Las Partituras del Terror. |
| Episodio 525: La Chispa Azul de Odio (2º Parte) |
| OVA 9: El Extraño Después de 10 Años |
| Episodio 529: La Dulce Organización del Misterio (2º Parte) |
| Especial de TV: Lupin III vs Detective Conan |
| Magic File 3: Shinichi & Ran - El Recuerdo de la Tabla de Mahjong y del Tanabata |
| Película 13: El Perseguidor Negro |
| Episodio 530: La Verdad Tras la Leyenda Urbana (1º Parte) |
| Episodio 562: El Secuestro del Arcoíris |
| OVA 10: Kid en la Isla Trampa |
| Episodio 570: Un Crimen que no Puede ser Probado |
| Película 14: El Barco Perdido del Cielo |
| Magic File 4: La Odisea del Okonomiyaki en Osaka |
| Episodio 571: Batalla por el Tesoro en el Almacén Encantado (1º Parte) |
| Episodio 609: La Traición del "White Day" (2º Parte) |
| Película 15: 15 Minutos de Silencio |
| Magic File 5: El Capricho del Souvenir de Nigata-Tokio |
| Episodio 610: La Víctima es Shinichi Kudo |
| Episodio 616: El libro del Apocalipsis de Holmes (Discípulo de Holmes) |
| OVA 11: Instrucciones Secretas Desde Londres |
| Episodio 641: El Viaje de las Ocho Piezas de la Memoria (Parte de Kurashiki) |
| OVA 12: El Milagro de Excalibur |
| Episodio 650: Rehenes en la Agencia de Detectives Mouri (Liberación) |
| Magic File 6: La Flor Fantasista |
| Película 16: El Undécimo Goleador |
| Episodio 651: Conan vs. Heiji: La Batalla de Deducciones Entre el Detective del Este y del Oeste (Especial 1 hora) |
| Episodio 694 (Magic File 7): Los Dulces Japoneses Desaparecidos en la Antigua Confitería |
| Película 17: El Detective del Lejano Mar |
| Episodio 695: Una Rosa en los Viñedos |
| Episodio 721: El Viaje del Misterio de Agua y Fuego (Parte de Kumamoto) |
| Película: Lupin III vs Detective Conan |
| Episodio 735 (Magic File 8): La Invitación Codificada |
| Película 18: El Francotirador de Otra Dimensión |
| Especial Kogoro Mouri: El Fugitivo |
| Episodio 736: El Secreto de la Estatua de Kogoro Mouri |
| Episodio 762: El Viaje del Misterio de Hyakumangoku y Kaga (Parte de Kaga) |
| Especial 2 horas: La Desaparición de Conan Edogawa - Los Dos Peores Días de la Historia |
| Episodio 774 (Magic File 9): El Grito Perdido de Munch |
| Película 19: Los Girasoles del Fuego Infernal |
| Episodio 775: El Gran Detective Manipulado (1º Parte) |
| Episodio 813 (Magic File10): La Sombra Acercándose a Amuro |
| Película 20: La Pesadilla de Negro Puro. |
| Episodio 814: El Caso de la Habitación Cerrada de la Actriz Bloguera (1º parte) |
| Episodio 841: El Cruce Lluvioso |
| Especial TV: Episodio UNO - El Detective que se Encogió |
| Episodio 855 (Magic File 11): El Misterio del Cinturón Negro Desaparecido |
| Película 21: Una Carta de Amor de Rojo Carmesí. |
| Episodio 856: El Secreto de la Pareja Celebre |
| Episodio 898 (Magic File 12): ¡El Pastel Derretido! |
| Película 22: El Ejecutor de Zero |
| Episodio 899: ¡El Grito del Verdadero Culpable! |
| Episodio 936 (Magic File 13): La Conspiración del Patio de Comidas |
| Película 23: El Puño de Azul Marino |
| Episodio 937: El Puño Mortal del Gigante Talos (Primera Parte) |
| Especial recopilatorio: La Coartada Escarlata |
| Episodio 1002 (Magic File 14): El Misterio de la Basura del Distrito Comercial Beika |
| Película 24: La Bala Escarlata |
| Episodio 1003: El Juego Perfecto de 36 Casillas (Primera parte) |
| Especial recopilatorio: Una Historia de Amor de la Policía Metropolitana - La Víspera de la Boda |
| Episodio 1039 (Magic File 15): La Calabaza de Halloween voladora |
| Película 25: La Novia de Halloween |
| Episodio 1040: Los casos del diario ilustrado de Ayumi 2 |
| Especial recopilatorio: El Tren del Mistero de Hierro Negro |
| Episodio 1080 (Magic File 16): Las cámaras que apuntan a Haibara |
| Película 26: EL Submarino de Hierro Negro |