Durante la fiesta de estreno de Cocoon, un juego de realidad virtual, llevada a cabo en el Beika City Hall, es asesinado el desarrollador del juego, Kashimura. A partir del mensaje póstumo dejado en la escena de crimen, Conan se da cuenta que la clave para resolver el caso estaría dentro del juego, ¡y decide participar en el juego virtual de vida o muerte!